Harlequin ist ein komplexes pigmentäres Merkmal der Fellfarbe, das durch ein Muster von charakteristischen schwarzen Flecken auf einem weißen Hintergrund gekennzeichnet ist. Es wird durch heterozygote Mutationen des Merle-Lokus und einen Modifikator-Locus für Harlequin kontrolliert. Das Harlequin-Gen beeinflusst den Phänotyp des Hundes nur in Kombination mit dem Merle-Gen. Wenn ein Hund einen nicht-merle Genotyp (mm) hat, wird das Harlequin-Gen den Phänotyp des Hundes nicht beeinflussen. Tiere mit dem HH-Genotyp sind nicht lebensfähig, da dies früh in der Embryogenese zur Letalität führt.

mm = nicht merle, Mm = merle, MM = doppel merle
hh = nicht harlequin, Hh = harlequin, HH = pränatal letal